Flagey-lès-Auxonne est un petit village français, situé dans le département de la Côte-d'Or et la région de Bourgogne-Franche-Comté (anciennement Région Bourgogne).

Ses habitants sont appelés les Flageyois et les Flageyoises.

La commune s'étend sur 7,9 km² et compte 197 habitants depuis le dernier recensement de la population datant de 2007. Avec une densité de 24,9 habitants par km², Flagey-lès-Auxonne a connu une nette hausse de 20,9% de sa population par rapport à 1999.

Entouré par les communes de Labergement-lès-Auxonne, Billey et Villers-Rotin, Flagey-lès-Auxonne est situé à 1 km au sud-est de Labergement-lès-Auxonne la plus grande ville à proximité.

Situé à 189 mètres d'altitude, le Ruisseau Bief des Prés Bas, le Ruisseau Bief Noirot sont les principaux cours d'eau qui traversent la commune de Flagey-lès-Auxonne.

La Mairie

L'église Saint-Laurent

Le Monument aux Morts